Cinq jeunes filles subissent par erreur une injection de gènes d'animaux menacés d'extinction. Elles se retrouvent alors dotées de pouvoir et se transforment en créature mi-humaine, mi-animale dès que les problèmes surviennent. Elles doivent combattre des Extra-terrestres qui veulent utiliser les animaux pour dominer la terre. Deux adolescents désirent prévenir cette invasion depuis leur base secrète, un innocent salon de thé. Avec l'aide de ces cinq jeunes filles, ils cherchent à sauver la Terre : il s'agit du projet Mew Mew ! Basé sur le manga "Tokyo Mew Mew" de Reiko Yoshida et Mia Ikumi.